A APEF atua nível nacional e internacional, junto de estruturas do Setor Farmacêutico, de Instituições de Ensino Superior que ministram o MICF e de Entidades Reguladoras da Saúde ou representativas da Juventude no âmbito político, baseando a sua atividade na representação e capacitação dos Estudantes de Ciências Farmacêuticas.

Pretendemos fomentar a análise crítica e a discussão coletiva dos assuntos relativos ao Ensino e à Profissão Farmacêutica, por forma a que a voz dos estudantes chegue às forças políticas representativas da classe, Instituições de Ensino Superior e Órgãos Governamentais do Estado, com vista à melhoria contínua da nossa formação académica.